Het onderzoek naar flora op het INBO is vrij divers en omvat onderzoek naar trends en verspreiding van vaatplanten, mossen en vegetaties, indicatorfunctie van planten voor Europese habitats van de Habitatrichtlijn, ecologische randvoorwaarden voor het overleven van bedreigde planten, herstelmaatregelen voor vegetaties, populatiegenetica, enz...